La Hermandad de Paciencia y Penas cuenta con marchas procesionales compuestas por músicos y hermanos que suenan a lo largo del recorrido procesional de cada Miércoles Santo:
«Angustia en tu Mirada» de Manuel Martín Molinero (1.999)
«Penas» de Alberto Haro Ortega
«A mi Virgencita» de A. Martín González (Francisco Higuero 2001)
«Miércoles Santo en Granada» de Miguel Sánchez Ruzafa (2002)
«María Santísima de las Penas» de Francisco Higuero Rosado;
«En tu rostro de Paciencia» de José María Sánchez Martín (2003);
«Flagellum» de Francisco David Álvarez Barroso (2011);
«De San Matías al Cielo» de Felipe Trujillo Lira (2014);
“Penas en San Matías” de Antonio Florián López Rodríguez (2016);
“Emperatriz del Realejo” de Rocío Bracero Cardona (2016);
«Señor de la Paciencia» de Ignacio José García Pérez (2017).
«María Santísima de las Penas» de Enrique Jimenez Galera (2022)
«Señora de San Matías» de Rubén Jordán Flores (2022)
«En tu Paciencia» de Carlos Moreno Camacho (2023)
«Sones de un Sueño» de Ignacio García Pérez (2023)
«Eternamente Tú» de Luis Márquez Salaverri (2024)